El Bachir Affar

Titre

• Chercheur adjoint

Formation

• Ph.D  Physiologie-Endocrinologie, Centre hospitalier de l'Université Laval (CHUL), Québec,1995-1999
• Postdoctorat   Laboratoire de recherche sur le Cancer de la peau, Centre hospitalier de l'Université Laval (CHUL), Québec, 1999-2000
• Postdoctorat   Département de pathologie, Harvard Medical School, Boston, USA., 2000-2006

Distinctions et Realisations

• Chercheur boursier junior 1 (FRSQ)
• Bourse Taplin, Université Harvard

Intérêts de recherche

• Signalisation cellulaire via l'ubiquitination.
• Processus associés à L'ADN et la chromatine (transcription et réparation de l'ADN).
• Bases moléculaires du cancer.

L'ubiquitination est une modification post-traductionnelle qui joue un rôle primordial dans la régulation de plusieurs fonctions cellulaires. D'un point de vue clinique, des mutations de nombreux gènes du système ubiquitine ont été liées de manière causale à diverses maladies, dont le cancer. L'ubiquitination est un processus réversible dû à la présence des déubiquitinases (enzymes qui enlèvent spécifiquement l'ubiquitine des protéines cibles). Bien que les déubiquitinases soient peu connues, elles sont néanmoins en train d'émerger comme des régulateurs centraux du système ubiquitine.

Notre objectif est de caractériser les fonctions biologiques et les mécanismes d'action des déubiquitinases impliquées dans la transcription et la réparation de l'ADN, deux processus dont la dérégulation joue un rôle fondamental dans le développement du cancer.

Spécifiquement, nous nous intéressons à une déubiquitinase nommée BAP1 (BRCA1-Associated Protein 1), qui est dotée de caractéristiques extrêmement prometteuses. En effet, BAP1 est une protéine nucléaire qui a précédemment été isolée en vertu de son interaction avec le suppresseur de tumeur BRCA1, ce dernier étant impliqué dans les processus de transcription et de réparation de l'ADN. De plus, il a été trouvé que BAP1 est muté de manière homozygote dans des cellules provenant de tumeurs du poumon. À l'exception de ces quelques données, la déubiquitinase BAP1 reste très marginalement connue.

Nous utilisons des approches de biochimie, de biologie moléculaire et de culture cellulaire afin de caractériser les fonctions des déubiquitinases, en particulier de BAP1.

Nos travaux devraient permettre une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires gouvernant le système ubiquitine. De plus, de nouveaux concepts pourront être développés concernant la régulation de la transcription et la réparation de l'ADN.

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Personnel de recherche 

Étudiants au doctorat:

• Ian hammond-Martel
• Helen Yu
• Salima Daou
• Nazar Mashtalir

Étudiant à la maîtrise:

• Mehdi Ghram

Technicienne:

• Diana Adjaoud, Technicienne

Publications choisies

Raphael Rouget , Yannick Auclair, Martin Loignon, El Bachir Affar, Elliot Drobetsky. A sensitive flow cytometry-based nucleotide excision repair assay unexpectedly reveals that mitogen-activated protein kinase signalling does not regulate the removal of UV-induced DNA damage in human cells. Journal of Biological Chemistry, 283(9):5533-5541, (2008).

Andrew A. Horwitz, El Bachir Affar, George F. Heine, Yang shi, Jeffrey D. Parvin. A novel mechanism for transcriptional repression dependent on the BRCA1 E3 ubiquitin ligase. Proc. Natl. Acad. Sci., 104(16):6614-6619, (2007).

Yu May Ma, Emmanuel Boucrot, Judit Villen, El Bachir Affar, Steven P. Gygi, Heinrich G. Gottlinger and Tomas Kirchhausen. Targeting of AMSH to endosomes is required for EGF receptor degradation. Journal of Biological Chemistry, 282(13):9805-9812, (2007).

El Bachir Affar, Margaret Po-shan Luke, Frédérique Gay, Dominica Calvo, Guangchao Sui, Robert S. Weiss, En Li, and Yang Shi. Targeted Ablation of Par-4 Reveals a Cell-Type Specific Susceptibility To Apoptosis-Inducing Agents. Cancer Research, 66(7):3456-3462, (2006).

El Bachir Affar*, Frédérique Gay*, Yujiang Shi, Huifei Liu, Maite Huarte, Su Wu, Collins Tucker, En Li, and Yang Shi. Essential dosage-dependent functions of the transcription factor Yin Yang 1 in late embryonic development and cell cycle progression. Molecular and Cellular Biology, 26(9):3565-3581, (2006). * Equal Contribution.

Sang Ki Park, Minh Dang Nguyen, André Fisher, Margaret Po-Shan Luke, El Bachir Affar, Paul B. Dieffenbach, Huang-Chun Tseng, Yang Shi and Li-Huei Tsai. Par-4 links dopamine signaling and depression. Cell,122(2):275-287, (2005).

Guangchao Sui, El Bachir Affar*, Yujiang Shi*, Chrystelle Brignone, Nathan R. Wall, Peng Yin, Mary Donohoe, Dominica Calvo, Margaret P. Luke, Steven R. Grossman, Yang Shi. Yin Yang 1 is a negative regulator of p53. Cell, 117(7): 859-872, (2004). * Equal contribution.

Yujiang Shi, Jun-ichi Sawada, Guangchao Sui, El Bachir Affar, Johnathan R. Whetstine, Fei Lan, Hidesato Ogawa, Margaret Po-Shan Luke, Yoshihiro Nakatani and Yang Shi. Coordinated histone modifications mediated by a CtBP co-repressor complex. Nature, 422(6933):735-738, (2003).

Guangchao Sui*, Christina Soohoo*, El Bachir Affar*, Frédérique Gay, Yujiang Shi, William Forrester and Yang Shi. A DNA vector-based RNAi technology to suppress gene expression in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci., 99:5515-5520, (2002). * Equal Contribution.

El Bachir Affar, Rashmi G. Shah, Annie K. Dallaire, Vincent Castonguay and Girish M. Shah. Role of poly(ADP-ribose) polymerase in rapid intracellular acidification induced by alkylating DNA damage. Proc. Natl. Acad. Sci., 99: 245-250, (2002).

Liste complète des publications du Dr Affar (PubMed)

Informations complémentaires

Subventions

• INCC
• FRSQ

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