El Bachir Affar

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Fax : 514-252-3430
Tél. laboratoire : 514-252-3400 poste 4683
el.bachir.affar@umontreal.ca

Axe de recherche  Immunologie-oncologie
Unité de recherche  Signalisation cellulaire et cancer

Titre

  • Chercheur Agrégé,  Département de médicine, Université de Montréal.
  • Accréditation au Département de Biochimie, Université de Montréal.
  • Accréditation aux Programmes Sciences Biomédicales, Université de Montréal.
  • Accréditation aux Programmes Biologie moléculaire, Université de Montréal.

Formation

  • Ph.D  Physiologie-Endocrinologie, Centre hospitalier de l'Université Laval (CHUL), Québec,1995-1999
  • Postdoctorat   Laboratoire de recherche sur le Cancer de la peau, Centre hospitalier de l'Université Laval (CHUL), Québec, 1999-2000
  • Postdoctorat   Département de pathologie, Harvard Medical School, Boston, USA., 2000-2006

Distinctions et Realisations

  • Chercheur boursier IRSC, Nouveau chercheur.
  • Chercheur boursier junior 2 FRSQ (Le Fonds de la recherche en santé du Québec)
  • Bourse Taplin, Université Harvard
  • Prix finaliste nouveau chercheur principal Maud Menten, Institut de Génétique, IRSC (2011)
  • Tableau d’honneur du Doyen (PhD), Université Laval, Canada (1999)

Intérêts de recherche

  • Signalisation cellulaire via l'ubiquitination.
  • Processus associés à L'ADN et la chromatine (transcription et réparation de l'ADN).
  • Bases moléculaires du cancer.

L'ubiquitination est une modification post-traductionnelle qui joue un rôle primordial dans la régulation de plusieurs fonctions cellulaires. D'un point de vue clinique, des mutations de nombreux gènes du système ubiquitine ont été liées de manière causale à diverses maladies, dont le cancer. L'ubiquitination est un processus réversible dû à la présence des déubiquitinases (enzymes qui enlèvent spécifiquement l'ubiquitine des protéines cibles). Bien que les déubiquitinases soient peu connues, elles sont néanmoins en train d'émerger comme des régulateurs centraux du système ubiquitine.

Notre objectif est de caractériser les fonctions biologiques et les mécanismes d'action des déubiquitinases impliquées dans la transcription et la réparation de l'ADN, deux processus dont la dérégulation joue un rôle fondamental dans le développement du cancer.

Spécifiquement, nous nous intéressons à une déubiquitinase nommée BAP1 (BRCA1-Associated Protein 1), qui est dotée de caractéristiques extrêmement prometteuses. En effet, BAP1 est une protéine nucléaire qui a précédemment été isolée en vertu de son interaction avec le suppresseur de tumeur BRCA1, ce dernier étant impliqué dans les processus de transcription et de réparation de l'ADN. De plus, il a été trouvé que BAP1 est muté de manière homozygote dans des cellules provenant de tumeurs du poumon. À l'exception de ces quelques données, la déubiquitinase BAP1 reste très marginalement connue.

Nous utilisons des approches de biochimie, de biologie moléculaire et de culture cellulaire afin de caractériser les fonctions des déubiquitinases, en particulier de BAP1.

Nos travaux devraient permettre une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires gouvernant le système ubiquitine. De plus, de nouveaux concepts pourront être développés concernant la régulation de la transcription et la réparation de l'ADN.

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Personnel de recherche 

Étudiants au doctorat:

  • Salima Daou
  • Haithem Barbour
    • Bourse d’excellence du gouvernement  tunisien 2013-2017
    • Bourse fondation Cole 2014-2016
  • Nadine Sen 
    • Bourse FRSQ 2014-2017
    • Bourse fondation Cole 2014-2016
    • Bourse de recutement de la faculté de médecine 2014
  • Louis Masclef

      Étudiant à la maîtrise:

      • Oumaima Ahmed
        • Bourse de la francophonie

      Stagiaire

      • Saad Mengaad

      Technicienne:

      • Diana Adjaoud

      Publications choisies

      Mashtalir N, Daou S, Barbour H, Sen NN, Gagnon J, Hammond-Martel I, Dar HH, Therrien M, Affar el B, Autodeubiquitination Protects the Tumor Suppressor BAP1 from Cytoplasmic Sequestration Mediated by the Atypical Ubiquitin Ligase UBE2O. Mol Cell. 2014 May 8;54(3):392-406.

      Yu H, Pak H, Hammond-Martel I, Ghram M, Rodrigue A, Daou S, Barbour H, Corbeil L, Hébert J, Drobetsky E, Masson JY, Di Noia JM, Affar el B, Tumor suppressor and deubiquitinase BAP1 promotes DNA double-strand break repair. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Jan 7;111(1):285-90.

      S Daou, N Mashtalir, I Hammond-Martel, H Pak, H Yu, G Sui, TM. Kristie and EB Affar.  Crosstalk Between O-GlcNAcylation And Proteolytic Cleavage Regulates The HCF-1 Maturation Pathway. Proc Natl Acad Sci., 2011;108(7):2747-52

      I Hammond-Martel, H Pak, H Yu, R Rouget, AA Horwitz, JD. Parvin, EA. Drobetsky and EB Affar. PI 3 Kinase Related Kinases-Independent Proteolysis of BRCA1 Regulates Rad51 Recruitment During Genotoxic Stress in Human Cells. PlosONE 10.1371/journal.pone.0014027 (2010).

      H Yu, N Mashtalir, S Daou, I Hammond-Martel, J Ross, G Sui, GW. Hart, FJ Rauscher III, EA Drobetsky, E Milot, Y Shi and EB Affar.The Ubiquitin Carboxyl Hydrolase BAP1 Forms a Ternary Complex with YY1 and HCF-1 and is a Critical Regulator of Gene Expression.  Mol. Cell. Biol.30(21):5071-85, (2010).

      Andrew A. Horwitz, El Bachir Affar, George F. Heine, Yang shi, Jeffrey D. Parvin. A novel mechanism for transcriptional repression dependent on the BRCA1 E3 ubiquitin ligase. Proc. Natl. Acad. Sci., 104(16):6614-6619, (2007).

      El Bachir Affar, Margaret Po-shan Luke, Frédérique Gay, Dominica Calvo, Guangchao Sui, Robert S. Weiss, En Li, and Yang Shi. Targeted Ablation of Par-4 Reveals a Cell-Type Specific Susceptibility To Apoptosis-Inducing Agents. Cancer Research, 66(7):3456-3462, (2006).

      El Bachir Affar*, Frédérique Gay*, Yujiang Shi, Huifei Liu, Maite Huarte, Su Wu, Collins Tucker, En Li, and Yang Shi. Essential dosage-dependent functions of the transcription factor Yin Yang 1 in late embryonic development and cell cycle progression. Molecular and Cellular Biology, 26(9):3565-3581, (2006). * Equal Contribution.

      Guangchao Sui, El Bachir Affar*, Yujiang Shi*, Chrystelle Brignone, Nathan R. Wall, Peng Yin, Mary Donohoe, Dominica Calvo, Margaret P. Luke, Steven R. Grossman, Yang Shi. Yin Yang 1 is a negative regulator of p53. Cell, 117(7): 859-872, (2004). * Equal contribution.

      Yujiang Shi, Jun-ichi Sawada, Guangchao Sui, El Bachir Affar, Johnathan R. Whetstine, Fei Lan, Hidesato Ogawa, Margaret Po-Shan Luke, Yoshihiro Nakatani and Yang Shi. Coordinated histone modifications mediated by a CtBP co-repressor complex. Nature, 422(6933):735-738, (2003).

      Liste complète des publications du Dr Affar (PubMed)

      Informations complémentaires

      Subventions

      • Instituts de recherche en santé du Canada
      • The Cancer Research Society (CRS)
      • The Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC)
      • The Canadian Cancer Society Research Institute (CCSRI) 
      • La Société de leucémie et lymphome du canada 2013-2015

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